160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1176 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  100 
 
 		 337 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.04 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  37.84 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  39.62 
 
 		 237 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  39.78 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  41.6 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  30.51 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  21.68 
 
 		 239 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.67 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.18 
 
 		 219 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  48.44 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.48 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  22.16 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.67 
 
 		 583 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  30.83 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.53 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  38.95 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  37.11 
 
 		 242 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.51 
 
 		 194 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  36.7 
 
 		 224 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  51.02 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.74 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  41.05 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  38 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  37.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.8 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.58 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  49.18 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  33.33 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0945  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.53 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 252 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.74 
 
 		 217 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  35.83 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  35.83 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.58 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  32.67 
 
 		 224 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.43 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.78 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.06 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  39.58 
 
 		 233 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  27.12 
 
 		 224 aa  46.2  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 		 242 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  32.69 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  39.39 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  32.69 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  46.97 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  32.69 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  35.46 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.78 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  32.69 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  42.17 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  32.69 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  35.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  37.93 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.88 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  35.19 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  33.66 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  33.66 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>