112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1167 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  54.59 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  33.59 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.87 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.22 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  28.57 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  31.02 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.1 
 
 		 370 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  28.52 
 
 		 325 aa  99  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  32.83 
 
 		 280 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.14 
 
 		 304 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  30.63 
 
 		 314 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  27.92 
 
 		 332 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  30.28 
 
 		 282 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  27.54 
 
 		 795 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  29.62 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.29 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.58 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  28.78 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.7 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.71 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  32.91 
 
 		 335 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.55 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.8 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  33.71 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.19 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.87 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  23.49 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  34.81 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  26.67 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  24.65 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.95 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  22.5 
 
 		 1002 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  27.18 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.67 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  30.12 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.31 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  31.92 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  35.2 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  28.29 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.12 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.78 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  29.11 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  30 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.87 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  30.71 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  31.01 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  26.75 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.26 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.48 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  35.2 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  35.2 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  29.37 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  34.4 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.69 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  30.95 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  31.18 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  30.97 
 
 		 239 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.47 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.83 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  31.49 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  34.43 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  28.68 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  25.71 
 
 		 243 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.67 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  34.94 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  32.79 
 
 		 365 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  31.71 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  32.79 
 
 		 365 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  26.51 
 
 		 363 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  32.79 
 
 		 365 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  31.2 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.14 
 
 		 260 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  27.53 
 
 		 331 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  34.9 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  26.88 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  29.83 
 
 		 338 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  32.26 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  30.56 
 
 		 387 aa  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  25 
 
 		 406 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  31.71 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  23.26 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  24.04 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  30.35 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.03 
 
 		 215 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  28.7 
 
 		 529 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  28.35 
 
 		 343 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  24.82 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  25.18 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  31.3 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>