More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1161 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  91.32 
 
 		 289 aa  531  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  75.09 
 
 		 282 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  78.75 
 
 		 272 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  79.54 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  71.85 
 
 		 316 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  79.62 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  78.24 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  76.17 
 
 		 279 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  75.09 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  79.84 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  74.44 
 
 		 296 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  78.99 
 
 		 292 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  74.63 
 
 		 353 aa  417  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  72.7 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  72.7 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  72.7 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  69.36 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  74.82 
 
 		 283 aa  407  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  74.63 
 
 		 278 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  76.15 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  75.1 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1863  Ribosomal protein S2-like protein  78.99 
 
 		 317 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  74.33 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  73.64 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  81.78 
 
 		 273 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  70.5 
 
 		 279 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  67.47 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  69.93 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  73.85 
 
 		 283 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  76.81 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  67.6 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  71.32 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06740  30S ribosomal protein S2  75.58 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1384  30S ribosomal protein S2  72.97 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000357638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1367  30S ribosomal protein S2  72.2 
 
 		 294 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.480409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  62.2 
 
 		 262 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0403  30S ribosomal protein S2  63.81 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000078779  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0809  ribosomal protein S2  60.52 
 
 		 272 aa  325  6e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  64.73 
 
 		 233 aa  324  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  65.18 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  65.18 
 
 		 232 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  62.33 
 
 		 235 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  65.62 
 
 		 244 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  63.84 
 
 		 244 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  61.43 
 
 		 235 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  65.62 
 
 		 236 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  61.37 
 
 		 235 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  63.84 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  57.09 
 
 		 262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  61.9 
 
 		 267 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  57.31 
 
 		 257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  62.05 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  61.43 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  60.96 
 
 		 257 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 255 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  62.33 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  62.33 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 255 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  62.28 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  61.88 
 
 		 233 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  62.72 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  62.73 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  62.78 
 
 		 250 aa  302  6.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  59.64 
 
 		 291 aa  300  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  62.28 
 
 		 255 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  62.05 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  62.95 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  60.96 
 
 		 256 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  61.84 
 
 		 251 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  58.17 
 
 		 252 aa  298  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  64.29 
 
 		 243 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  55.34 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  60.71 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  61.5 
 
 		 289 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  60.89 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  56.68 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  54.79 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  59.19 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  56.43 
 
 		 281 aa  291  9e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  59.01 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0123  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 262 aa  290  3e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  62.44 
 
 		 343 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  62.44 
 
 		 314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  56.1 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 264 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  58.44 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  56.49 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  58.44 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  61.99 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  58.67 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>