More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1145 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.83 
 
 		 1186 aa  956    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  49.42 
 
 		 1217 aa  947    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  53.85 
 
 		 1183 aa  958    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  50.98 
 
 		 1203 aa  916    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  50.23 
 
 		 1213 aa  909    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  48.91 
 
 		 1194 aa  944    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  72.86 
 
 		 1222 aa  1529    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  48.79 
 
 		 1194 aa  914    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  48.23 
 
 		 1214 aa  888    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  51.51 
 
 		 1194 aa  1061    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  49.57 
 
 		 1195 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  52.16 
 
 		 1191 aa  1061    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  47.48 
 
 		 1205 aa  879    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1263 aa  2408    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  47.72 
 
 		 1195 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  47.64 
 
 		 1195 aa  896    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  52.17 
 
 		 1224 aa  1081    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  52.31 
 
 		 1198 aa  999    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  50.42 
 
 		 1222 aa  964    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  50.9 
 
 		 1188 aa  1016    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  47.72 
 
 		 1195 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  49.72 
 
 		 1199 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  63.71 
 
 		 1198 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  53.62 
 
 		 1191 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  49.61 
 
 		 1181 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  48.41 
 
 		 1227 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  52.96 
 
 		 1188 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  50.34 
 
 		 1218 aa  489  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  59.76 
 
 		 1191 aa  489  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  49.59 
 
 		 1194 aa  479  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  50.99 
 
 		 1188 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  72.78 
 
 		 1234 aa  458  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 		 1187 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.86 
 
 		 1196 aa  439  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  60.05 
 
 		 1217 aa  436  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.1 
 
 		 1187 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1185 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.42 
 
 		 1191 aa  410  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.43 
 
 		 1173 aa  397  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  55.41 
 
 		 1172 aa  363  9e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.72 
 
 		 1178 aa  363  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.45 
 
 		 1186 aa  355  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 		 1179 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  36.33 
 
 		 1225 aa  340  9.999999999999999e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1185 aa  326  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.27 
 
 		 1169 aa  324  7e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  57.56 
 
 		 1186 aa  284  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 		 1190 aa  284  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  58.55 
 
 		 1184 aa  281  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  58.22 
 
 		 1185 aa  281  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  36.71 
 
 		 1190 aa  280  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  38.79 
 
 		 1179 aa  274  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  54.7 
 
 		 1174 aa  273  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.93 
 
 		 1187 aa  271  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.9 
 
 		 1189 aa  271  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.47 
 
 		 1134 aa  268  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1189 aa  268  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1185 aa  266  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.04 
 
 		 1189 aa  265  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.9 
 
 		 1189 aa  262  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.9 
 
 		 1189 aa  262  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.03 
 
 		 1189 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.9 
 
 		 1189 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.9 
 
 		 1189 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.03 
 
 		 1189 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.9 
 
 		 1189 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1198 aa  253  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  52.17 
 
 		 1190 aa  253  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 		 1186 aa  252  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  37.92 
 
 		 1184 aa  251  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  55.12 
 
 		 1185 aa  251  7e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  42.9 
 
 		 1176 aa  250  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1188 aa  250  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1188 aa  250  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  54.63 
 
 		 1185 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  38.56 
 
 		 1185 aa  244  9e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  44.52 
 
 		 1176 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  50.86 
 
 		 1177 aa  243  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  50.86 
 
 		 1198 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  46.88 
 
 		 1199 aa  238  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  36.71 
 
 		 1176 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  41.36 
 
 		 1176 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  48.13 
 
 		 1174 aa  237  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  51.15 
 
 		 1176 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  41.42 
 
 		 1301 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  45.61 
 
 		 1199 aa  236  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  45.61 
 
 		 1199 aa  236  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  53.52 
 
 		 1189 aa  235  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  44.37 
 
 		 1081 aa  232  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  44.01 
 
 		 1175 aa  231  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  47.01 
 
 		 1179 aa  229  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  44.94 
 
 		 1177 aa  229  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  47.09 
 
 		 1177 aa  225  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  43.87 
 
 		 1189 aa  223  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  49.77 
 
 		 1191 aa  218  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.71 
 
 		 1149 aa  218  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  39.25 
 
 		 1255 aa  216  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.79 
 
 		 1177 aa  214  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 		 1163 aa  213  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.03 
 
 		 1204 aa  212  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>