10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1144 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1144  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.717129  decreased coverage  0.00895911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2777  hypothetical protein  53.85 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506284  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7992  hypothetical protein  50.77 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2123  hypothetical protein  49.23 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0369772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0215  hypothetical protein  56.25 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3430  hypothetical protein  54.41 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1180  hypothetical protein  61.9 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192908  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1290  hypothetical protein  61.9 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1571  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0631142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8009  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>