More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1091 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
174 aa  340  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  93.1 
 
 
174 aa  318  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  83.91 
 
 
174 aa  293  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  82.14 
 
 
168 aa  284  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  79.89 
 
 
174 aa  282  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  79.89 
 
 
174 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.55 
 
 
168 aa  276  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  78.82 
 
 
207 aa  274  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  80.24 
 
 
184 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.86 
 
 
174 aa  264  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  75.15 
 
 
170 aa  262  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10690  acetolactate synthase, small subunit  78.16 
 
 
174 aa  258  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.492903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.48 
 
 
171 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1336  acetolactate synthase, small subunit  74.56 
 
 
170 aa  253  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275336  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  80 
 
 
169 aa  249  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  70.11 
 
 
174 aa  249  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  73.46 
 
 
167 aa  246  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  75.29 
 
 
174 aa  246  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2863  acetolactate synthase, small subunit  75.93 
 
 
167 aa  245  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0612  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.29 
 
 
174 aa  237  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0971512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  69.14 
 
 
175 aa  237  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0172  acetolactate synthase, small subunit  73.56 
 
 
174 aa  235  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.693447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  71.95 
 
 
171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.07 
 
 
172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  71.86 
 
 
175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.07 
 
 
172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.07 
 
 
172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.7 
 
 
168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.68 
 
 
166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.52 
 
 
166 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  68.9 
 
 
172 aa  224  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2385  acetolactate synthase, small subunit  70.59 
 
 
173 aa  223  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08540  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.87 
 
 
169 aa  211  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.097945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.68 
 
 
170 aa  203  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000416334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2538  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.68 
 
 
170 aa  202  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000724925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1043  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.74 
 
 
184 aa  202  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.678602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  56.63 
 
 
170 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  56.17 
 
 
169 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.6 
 
 
161 aa  187  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  54.04 
 
 
170 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.62 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  53.16 
 
 
165 aa  179  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  55.9 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  55.9 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
163 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
163 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.2 
 
 
163 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.46 
 
 
163 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 
162 aa  175  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  55.28 
 
 
164 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  53.12 
 
 
166 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.25 
 
 
172 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.25 
 
 
172 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.94 
 
 
163 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.05 
 
 
174 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.05 
 
 
174 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
172 aa  174  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.05 
 
 
174 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.85 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.44 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  55.41 
 
 
172 aa  171  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.66 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
167 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
167 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
167 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13211  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
174 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.463823  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
161 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
182 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.05 
 
 
176 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.56 
 
 
164 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.06 
 
 
165 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1977  acetolactate synthase, small subunit  50.3 
 
 
178 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
176 aa  168  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
176 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1986  acetolactate synthase, small subunit  50.3 
 
 
178 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  55.48 
 
 
168 aa  168  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  48.78 
 
 
167 aa  167  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.57 
 
 
169 aa  167  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  51.28 
 
 
185 aa  167  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1901  acetolactate synthase, small subunit  50.61 
 
 
178 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
163 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.94 
 
 
169 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.94 
 
 
169 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  51.88 
 
 
160 aa  167  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.23 
 
 
175 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
163 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  49.06 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.9 
 
 
163 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.25 
 
 
168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  52.5 
 
 
165 aa  164  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.15 
 
 
171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.47 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  48.12 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1878  acetolactate synthase, small subunit  49.09 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0996051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.23 
 
 
172 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>