190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1054 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  90.58 
 
 
191 aa  358  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  84.82 
 
 
222 aa  332  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  81.68 
 
 
191 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  79.06 
 
 
191 aa  315  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  78.01 
 
 
191 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  75.92 
 
 
192 aa  309  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  75.92 
 
 
191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  74.35 
 
 
191 aa  299  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  74.35 
 
 
192 aa  293  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  69.11 
 
 
191 aa  284  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  68.59 
 
 
192 aa  277  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  66.84 
 
 
192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  66.84 
 
 
192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  66.84 
 
 
192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  67.35 
 
 
194 aa  270  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  65.97 
 
 
192 aa  270  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  71.96 
 
 
193 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  67.35 
 
 
194 aa  266  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  71.43 
 
 
205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  64.21 
 
 
192 aa  264  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  64.92 
 
 
191 aa  263  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  65.79 
 
 
192 aa  262  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  61.78 
 
 
192 aa  254  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  62.83 
 
 
191 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  62.83 
 
 
191 aa  254  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  61.78 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  61.78 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  61.78 
 
 
192 aa  252  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  60.73 
 
 
192 aa  252  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  61.78 
 
 
191 aa  249  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  61.78 
 
 
191 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  62.96 
 
 
191 aa  248  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  62.83 
 
 
191 aa  248  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  59.79 
 
 
191 aa  247  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  62.3 
 
 
192 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  61.78 
 
 
191 aa  246  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  60.21 
 
 
191 aa  245  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  57.07 
 
 
192 aa  245  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  60.53 
 
 
191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  59.47 
 
 
191 aa  243  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  59.47 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  61.78 
 
 
192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  60.73 
 
 
191 aa  235  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  56.54 
 
 
248 aa  234  7e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  56.54 
 
 
192 aa  231  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  61.9 
 
 
191 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  57.07 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  53.4 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  54.45 
 
 
191 aa  214  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  52.63 
 
 
192 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  52.36 
 
 
192 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  52.36 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  52.36 
 
 
192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  51.83 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  49.47 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  54.74 
 
 
192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  52.63 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  54.74 
 
 
192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  53.16 
 
 
196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  53.68 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  51.83 
 
 
192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  51.83 
 
 
192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  51.83 
 
 
192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  53.16 
 
 
194 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  52.13 
 
 
190 aa  211  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  52.91 
 
 
190 aa  210  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  52.63 
 
 
196 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  52.63 
 
 
196 aa  209  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  52.63 
 
 
194 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  52.63 
 
 
194 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  52.63 
 
 
194 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  52.11 
 
 
194 aa  208  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  52.11 
 
 
194 aa  207  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  49.47 
 
 
191 aa  204  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  50.53 
 
 
194 aa  203  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  49.21 
 
 
192 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  51.85 
 
 
192 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  49.47 
 
 
194 aa  201  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  47.62 
 
 
192 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  49.19 
 
 
199 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  49.19 
 
 
199 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  49.74 
 
 
194 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  49.74 
 
 
194 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  47.64 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  43.56 
 
 
200 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  45.74 
 
 
184 aa  175  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  40.4 
 
 
200 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  43.62 
 
 
184 aa  168  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1164  stress protein  45.36 
 
 
191 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5504  stress protein  41.12 
 
 
218 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390386  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  42.7 
 
 
198 aa  157  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  43.24 
 
 
198 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  42.7 
 
 
198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  42.16 
 
 
198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>