80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1019 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 82 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3712  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  80.26 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  62.69 
 
 		 74 aa  87.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  54.88 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  54.41 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  60.61 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  56.72 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  56.92 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.53 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  51.52 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  53.03 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  51.47 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  49.25 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  53.03 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  50.75 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.25 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  67.65 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.59 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  43.28 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  50.79 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  63.49 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  55.22 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  37.1 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.85 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.85 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1800  ATP synthase F0, C subunit  52.56 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.217172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  38.3 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  45.28 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  32.26 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  45.28 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  45.28 
 
 		 81 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.86 
 
 		 75 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  42.37 
 
 		 111 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  39.29 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  36.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0990  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.447801  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  32.79 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  38.1 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>