More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0914 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  920    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  51.61 
 
 
444 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  49.66 
 
 
452 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  49.77 
 
 
574 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  50 
 
 
438 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  49.77 
 
 
451 aa  362  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  50 
 
 
503 aa  362  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  48.27 
 
 
457 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  48.86 
 
 
471 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  48.86 
 
 
471 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  48.86 
 
 
470 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  47.95 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  46.61 
 
 
450 aa  351  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  49.52 
 
 
486 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  46.19 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  46.36 
 
 
455 aa  331  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  49.08 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  44.91 
 
 
452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  44.74 
 
 
455 aa  326  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  47.95 
 
 
450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  48.69 
 
 
439 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  48.6 
 
 
453 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  42.44 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  46.83 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  44.34 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  44.87 
 
 
445 aa  313  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  44.34 
 
 
453 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  46.28 
 
 
438 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  44.09 
 
 
443 aa  309  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  45.88 
 
 
451 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  42.52 
 
 
451 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  45.54 
 
 
520 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  44.74 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  41.09 
 
 
452 aa  269  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  40.87 
 
 
452 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  40.48 
 
 
462 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  42.44 
 
 
441 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  39.66 
 
 
496 aa  259  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  43.18 
 
 
453 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  40.39 
 
 
451 aa  253  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.23 
 
 
437 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  43.18 
 
 
451 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.26 
 
 
446 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  40.34 
 
 
458 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  40.34 
 
 
458 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  40.34 
 
 
458 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  41.41 
 
 
469 aa  246  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  38.41 
 
 
460 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  42.75 
 
 
455 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  34.52 
 
 
446 aa  236  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.12 
 
 
442 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  37.88 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  38.46 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  35.57 
 
 
437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  40.1 
 
 
478 aa  232  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  39.46 
 
 
450 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  31.41 
 
 
451 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  30.98 
 
 
449 aa  230  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  38.43 
 
 
431 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  40.05 
 
 
464 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  39.86 
 
 
459 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  31.16 
 
 
443 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  31.55 
 
 
443 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  30.7 
 
 
443 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 
451 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  31.41 
 
 
451 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 
451 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.36 
 
 
428 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  31.41 
 
 
451 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  30.63 
 
 
443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  31.32 
 
 
444 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  30.3 
 
 
448 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  30.62 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  30.62 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  34.04 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  41.71 
 
 
468 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  37.61 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.3 
 
 
442 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  29.33 
 
 
435 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.54 
 
 
442 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.7 
 
 
437 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.79 
 
 
440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.07 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.3 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  29.33 
 
 
435 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.3 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.3 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
442 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  31.34 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  29.21 
 
 
435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  30.42 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  34.35 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.64 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.64 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.64 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.64 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  34.35 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  38.92 
 
 
348 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.11 
 
 
432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>