38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0850 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
250 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  70.54 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  41.75 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  37.26 
 
 
224 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  37.26 
 
 
224 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  37.26 
 
 
224 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  37.8 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  38.24 
 
 
221 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0010  fatty acid hydroxylase  36.67 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  30.95 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  31.55 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  32.72 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  30.36 
 
 
209 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  30.95 
 
 
209 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  30.36 
 
 
209 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  30.36 
 
 
209 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  30.36 
 
 
209 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  32.1 
 
 
209 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  29.76 
 
 
209 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  32.28 
 
 
210 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33435  predicted protein  29.21 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4993  fatty acid hydroxylase  49.23 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  29.93 
 
 
209 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  28.14 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  27.1 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  32.61 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  26.03 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  24.86 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  25.9 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  27.21 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  30.1 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  29.2 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  27.15 
 
 
490 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  28.47 
 
 
376 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>