More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0829 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
971 aa  1053  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
958 aa  1001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
922 aa  708  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
949 aa  1078  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
954 aa  679  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
984 aa  1006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
985 aa  1003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
807 aa  662  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
806 aa  670  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  57 
 
 
978 aa  1090  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
805 aa  751  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
854 aa  710  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 
951 aa  1033  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  72.85 
 
 
1064 aa  1483  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
806 aa  677  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
805 aa  676  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
923 aa  713  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
806 aa  712  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.79205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  56.29 
 
 
954 aa  1078  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
971 aa  1053  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
968 aa  1039  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
984 aa  1041  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 
968 aa  1040  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
805 aa  745  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
833 aa  730  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
808 aa  717  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
804 aa  670  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
829 aa  701  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
829 aa  694  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  40.12 
 
 
899 aa  652  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
838 aa  680  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
969 aa  720  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
936 aa  717  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
971 aa  1053  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
921 aa  702  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
934 aa  1037  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
949 aa  1035  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
906 aa  794  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
969 aa  1030  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
805 aa  684  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  50.59 
 
 
994 aa  964  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
949 aa  698  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
858 aa  652  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
835 aa  642  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 
963 aa  1102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
804 aa  723  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
936 aa  808  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
982 aa  1043  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
944 aa  699  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
833 aa  733  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 
952 aa  1030  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
925 aa  704  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
857 aa  782  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1016 aa  2049  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
987 aa  980  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
950 aa  1078  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
952 aa  1051  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 
978 aa  1020  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
805 aa  636  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
819 aa  654  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
805 aa  680  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
990 aa  998  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
805 aa  676  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
802 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  43.95 
 
 
879 aa  616  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  39 
 
 
857 aa  617  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
802 aa  606  1e-172  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
802 aa  603  1e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
802 aa  603  1e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
802 aa  603  1e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
802 aa  602  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
802 aa  602  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
802 aa  602  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
802 aa  602  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
802 aa  602  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
802 aa  602  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
804 aa  593  1e-168  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
806 aa  582  1e-164  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
804 aa  567  1e-160  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
823 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
800 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
807 aa  559  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
801 aa  555  1e-156  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
858 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
872 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
830 aa  549  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.31776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
824 aa  546  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
825 aa  548  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
817 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
810 aa  544  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
865 aa  546  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
904 aa  542  1e-152  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
828 aa  542  1e-152  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
865 aa  540  1e-152  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
819 aa  540  1e-152  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
859 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
829 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
824 aa  537  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
840 aa  534  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
819 aa  535  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>