More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0806 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3924  signal peptide peptidase A  64.23 
 
 		 682 aa  741    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 651 aa  1262    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.09 
 
 		 566 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.85 
 
 		 570 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.16 
 
 		 563 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  42.63 
 
 		 569 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.31 
 
 		 562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.72 
 
 		 593 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.72 
 
 		 593 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.55 
 
 		 593 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  39.5 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.34 
 
 		 594 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.77 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.28 
 
 		 561 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.95 
 
 		 589 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.37 
 
 		 656 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.4 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.57 
 
 		 585 aa  216  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.38 
 
 		 605 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  43.81 
 
 		 593 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  29.65 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.73 
 
 		 604 aa  197  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  29 
 
 		 583 aa  197  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.45 
 
 		 598 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.45 
 
 		 598 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 		 571 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  28.36 
 
 		 612 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  26.28 
 
 		 618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.57 
 
 		 629 aa  177  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  29.1 
 
 		 610 aa  177  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.38 
 
 		 615 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  25.74 
 
 		 566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  33.15 
 
 		 834 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.76 
 
 		 595 aa  173  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.19 
 
 		 617 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.15 
 
 		 605 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.15 
 
 		 605 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.04 
 
 		 616 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  27.86 
 
 		 618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  27.86 
 
 		 618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  27.68 
 
 		 618 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  27.5 
 
 		 618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  28.32 
 
 		 618 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.34 
 
 		 834 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  38.46 
 
 		 608 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.97 
 
 		 831 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.72 
 
 		 597 aa  160  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.18 
 
 		 595 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.84 
 
 		 561 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.8 
 
 		 649 aa  156  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.89 
 
 		 614 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  35.5 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.6 
 
 		 615 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.7 
 
 		 596 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.17 
 
 		 313 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.6 
 
 		 615 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.6 
 
 		 615 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.91 
 
 		 640 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.2 
 
 		 614 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.09 
 
 		 339 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  35.16 
 
 		 621 aa  146  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.6 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.23 
 
 		 299 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.2 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.2 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.2 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.53 
 
 		 298 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  42.57 
 
 		 633 aa  145  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.2 
 
 		 615 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.1 
 
 		 348 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  35.13 
 
 		 617 aa  144  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  38.07 
 
 		 513 aa  144  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.51 
 
 		 633 aa  143  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40 
 
 		 296 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  33.81 
 
 		 616 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.76 
 
 		 613 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  44.39 
 
 		 580 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  39.5 
 
 		 616 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.8 
 
 		 274 aa  142  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.93 
 
 		 834 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.38 
 
 		 637 aa  141  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.32 
 
 		 342 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36 
 
 		 611 aa  140  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.82 
 
 		 617 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  33.45 
 
 		 616 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0654  peptidase S49  42.38 
 
 		 536 aa  140  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.17 
 
 		 587 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  38.46 
 
 		 616 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.96 
 
 		 613 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  40.35 
 
 		 601 aa  140  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.2 
 
 		 617 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.24 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.3 
 
 		 299 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  36.69 
 
 		 611 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  38.79 
 
 		 616 aa  138  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  35.91 
 
 		 340 aa  138  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  42.15 
 
 		 555 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.87 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.32 
 
 		 625 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  38.72 
 
 		 301 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>