16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0749 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  31.29 
 
 
380 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  29.55 
 
 
397 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  31.52 
 
 
441 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  28.69 
 
 
392 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  31.61 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  28.47 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  33.45 
 
 
436 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  26.67 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  25.3 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  25.7 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3169  hypothetical protein  33.94 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0150  hypothetical protein  26.29 
 
 
443 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.369898 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5253  hypothetical protein  24.52 
 
 
435 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.927267  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  18.93 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3031  hypothetical protein  26.6 
 
 
443 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>