214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0740 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  88.55 
 
 		 594 aa  1093    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 594 aa  1214    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  55.68 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  55.65 
 
 		 613 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  55.07 
 
 		 599 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  52.8 
 
 		 612 aa  611  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  52.22 
 
 		 613 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  48.52 
 
 		 612 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  48.22 
 
 		 619 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  48.05 
 
 		 617 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  47.26 
 
 		 623 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  46.74 
 
 		 625 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  46.93 
 
 		 608 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  43.82 
 
 		 606 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  43.46 
 
 		 656 aa  509  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  46.27 
 
 		 608 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  45.79 
 
 		 609 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  46.9 
 
 		 624 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  45.38 
 
 		 603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  41.75 
 
 		 598 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41 
 
 		 625 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  40.26 
 
 		 595 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  42.88 
 
 		 617 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  42.95 
 
 		 617 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  41.48 
 
 		 601 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  40.68 
 
 		 611 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  40.84 
 
 		 636 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  43 
 
 		 621 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  41.2 
 
 		 611 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  41.28 
 
 		 619 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  40.91 
 
 		 596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  41.94 
 
 		 602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  39.07 
 
 		 598 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  40.58 
 
 		 626 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  40.23 
 
 		 613 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  40.37 
 
 		 597 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  39.94 
 
 		 679 aa  405  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  39.6 
 
 		 605 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  38.94 
 
 		 601 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  39.86 
 
 		 626 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  40.41 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  40.17 
 
 		 609 aa  399  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  40.61 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  39.35 
 
 		 645 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  39.53 
 
 		 608 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  40.58 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  40.3 
 
 		 586 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  40.17 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  39.83 
 
 		 609 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  38.47 
 
 		 617 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  39.87 
 
 		 623 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  41.03 
 
 		 599 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  41.59 
 
 		 635 aa  395  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  39.77 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  40.48 
 
 		 636 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  39.58 
 
 		 672 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  40.44 
 
 		 594 aa  395  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  41.3 
 
 		 600 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  40.65 
 
 		 596 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  40.99 
 
 		 616 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  39.4 
 
 		 627 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  39.1 
 
 		 677 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  39.15 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  39.1 
 
 		 677 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  39.58 
 
 		 668 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  39.1 
 
 		 677 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  38.98 
 
 		 665 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  39.15 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  39.15 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  42.6 
 
 		 617 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  38.98 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  39.2 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  41.86 
 
 		 639 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  38.64 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  39.77 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  38.32 
 
 		 627 aa  382  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  38.34 
 
 		 602 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  38.64 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  38.64 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  38.64 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  38.64 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  38.64 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  38.51 
 
 		 642 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  37.19 
 
 		 629 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  39.14 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  37.74 
 
 		 628 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  38.97 
 
 		 619 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  37.56 
 
 		 602 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  39.93 
 
 		 627 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  38.06 
 
 		 626 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5896  glycoside hydrolase 15-related  40.95 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0215966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  37.31 
 
 		 600 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  39.77 
 
 		 627 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  39.56 
 
 		 602 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  39.24 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  38.44 
 
 		 635 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  37.5 
 
 		 601 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  38.47 
 
 		 869 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  37.73 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>