28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0733 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2028  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.43 
 
 		 528 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0712084  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2766  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.06 
 
 		 530 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6447  Xanthine/uracil/vitamin C permease  66.28 
 
 		 530 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321531  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2810  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.06 
 
 		 530 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3054  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.12 
 
 		 533 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.951228  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0733  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 596 aa  1162    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2756  hypothetical protein  49.28 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2657  hypothetical protein  46.26 
 
 		 526 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728518  normal  0.0923738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18531  permease  35.87 
 
 		 533 aa  306  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.632317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2322  hypothetical protein  34.47 
 
 		 589 aa  304  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3142  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.18 
 
 		 514 aa  300  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.097798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1746  hypothetical protein  38.24 
 
 		 519 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00122276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0005  hypothetical protein  34.02 
 
 		 531 aa  289  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.528166  normal  0.285686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2707  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.23 
 
 		 527 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.458027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4444  xanthine/uracil/vitamin C permease  31.97 
 
 		 501 aa  258  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3202  MFS transporter xanthine/uracil permease  32.37 
 
 		 518 aa  236  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13078  predicted protein  29.78 
 
 		 480 aa  193  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04862  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family protein  32.49 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10988  predicted protein  27.74 
 
 		 444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3148  sulphate transporter  30.23 
 
 		 535 aa  180  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03660  hypothetical protein  26.86 
 
 		 497 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  27.21 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 434 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 434 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.85 
 
 		 443 aa  44.3  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  28.31 
 
 		 444 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  28.31 
 
 		 444 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.24 
 
 		 443 aa  43.9  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>