86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0698 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0698  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  91.03 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  45.33 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  40 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  39.24 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  35.9 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  42.11 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  38.46 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  40 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1474  protein of unknown function DUF86  41.03 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.173165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  33.8 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0203  protein of unknown function DUF86  44.74 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1297  hypothetical protein  34.62 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  34.62 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2454  protein of unknown function DUF86  36 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2417  hypothetical protein  40.24 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629588  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  35.44 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  35.9 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  34.62 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0685  hypothetical protein  36.49 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3906  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  39.71 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  29.49 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3145  protein of unknown function DUF86  32.5 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  38.89 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  31.51 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  35.62 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  32.05 
 
 
120 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  34.67 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  32.39 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3032  hypothetical protein  34.29 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.488274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2071  protein of unknown function DUF86  34.94 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012332  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3961  hypothetical protein  36 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.626925  normal  0.333719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  32.88 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  32.88 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3141  protein of unknown function DUF86  29.49 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2968  protein of unknown function DUF86  29.49 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  37.33 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  38.89 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  36.11 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50240  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.753692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2886  hypothetical protein  41.56 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.116499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  26.67 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  42 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0153  hypothetical protein  37.33 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3150  protein of unknown function DUF86  41.56 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.75106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  33.8 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  29.87 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1293  protein of unknown function DUF86  34.29 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.053291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  35 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0846  hypothetical protein  36.11 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  31 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  30.43 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  41.18 
 
 
83 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  36 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3537  hypothetical protein  36.76 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134567  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2871  protein of unknown function DUF86  29.33 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  0.932974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2706  hypothetical protein  36.73 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.733685  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2149  protein of unknown function DUF86  38.89 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  31.34 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  31.34 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  27.03 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  38.89 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  28.57 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4908  protein of unknown function DUF86  29.87 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1165  hypothetical protein  45.95 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  29.33 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  48.78 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2423  hypothetical protein  31.11 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5351  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  28.21 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  32.69 
 
 
117 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1202  hypothetical protein  34.04 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0520235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  29.33 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  32.88 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2671  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0948  hypothetical protein  26.67 
 
 
62 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.774852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>