More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0663 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0663  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 453 aa  877    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  61.15 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  43.43 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.79 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.39 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.78 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  40.14 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.95 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.57 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.91 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.91 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.49 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  38.63 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.34 
 
 		 421 aa  194  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.28 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  35.45 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  31.97 
 
 		 400 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  36.57 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.14 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.03 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.86 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.65 
 
 		 410 aa  162  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.04 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.1 
 
 		 411 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.47 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.42 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.62 
 
 		 415 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.7 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.78 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  31.34 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.88 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  33.41 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  35.35 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.47 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  31.62 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.09 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.34 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.68 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.13 
 
 		 508 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.15 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.66 
 
 		 442 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.84 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  30.02 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.76 
 
 		 440 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.86 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  25.18 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.02 
 
 		 413 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.49 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  30.3 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  28.9 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  31.37 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  28.12 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  24.01 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  28.43 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.02 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  31.56 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  31.56 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  31.56 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.3 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  31.56 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  31.56 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  31.56 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  31.56 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  30.53 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  29.33 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  29.33 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  30.94 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  30.54 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  32.07 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  29.33 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  28.12 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  28.06 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  27.64 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  32.72 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  27.74 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  30.82 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  25.12 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  26.61 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.15 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  27.54 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  28.17 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2862  diaminopimelate decarboxylase  28.89 
 
 		 423 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0197535  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  27.9 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  26.24 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.23 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  29.57 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  25.72 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  28.95 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  29.57 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  26 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>