28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0654 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  92.13 
 
 		 356 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.29 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.77 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.59 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.79 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.2 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.67 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.97 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.96 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  32.04 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.67 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.57 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.5 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.5 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.5 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.5 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.2 
 
 		 312 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.12 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.07 
 
 		 342 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.84 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>