More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0634 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  100 
 
 
324 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  81.79 
 
 
331 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.1 
 
 
327 aa  374  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  56.15 
 
 
323 aa  342  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  54.49 
 
 
347 aa  338  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.66 
 
 
341 aa  332  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.01 
 
 
319 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.95 
 
 
354 aa  328  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  54.37 
 
 
350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  55.63 
 
 
359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  54.87 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.06 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  51.83 
 
 
327 aa  325  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.92 
 
 
343 aa  325  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.82 
 
 
325 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  54.55 
 
 
331 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  53.4 
 
 
350 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.86 
 
 
330 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  54.87 
 
 
331 aa  322  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  47.73 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  55.22 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  52.05 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.61 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  49.35 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  50.65 
 
 
457 aa  319  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  48.7 
 
 
320 aa  318  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  48.38 
 
 
320 aa  318  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.04 
 
 
337 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.26 
 
 
319 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  48.03 
 
 
318 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52 
 
 
324 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.17 
 
 
321 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  50 
 
 
323 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.22 
 
 
318 aa  316  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.15 
 
 
351 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
313 aa  315  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.29 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.19 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  50 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  54.21 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.86 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.77 
 
 
323 aa  311  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  51.78 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.84 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  53.25 
 
 
323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.52 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  55.15 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  48.85 
 
 
310 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  53.61 
 
 
332 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.56 
 
 
339 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0485  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.43 
 
 
327 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.31 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.65 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.97 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.97 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.97 
 
 
320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  49.32 
 
 
320 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  48.32 
 
 
309 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  47.21 
 
 
310 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  47.84 
 
 
310 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  47.84 
 
 
310 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.21 
 
 
325 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  49.32 
 
 
320 aa  298  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  53.6 
 
 
302 aa  298  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.33 
 
 
317 aa  298  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  47.18 
 
 
310 aa  298  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.51 
 
 
310 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  47.51 
 
 
310 aa  296  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.85 
 
 
315 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.86 
 
 
306 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.86 
 
 
306 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  46.67 
 
 
308 aa  296  5e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  49.68 
 
 
372 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.33 
 
 
310 aa  295  9e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  46.05 
 
 
309 aa  293  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.84 
 
 
324 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  53.36 
 
 
342 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.59 
 
 
314 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  53.51 
 
 
328 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.33 
 
 
313 aa  292  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.65 
 
 
305 aa  292  6e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  44.59 
 
 
309 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  52.48 
 
 
318 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.08 
 
 
305 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  47.64 
 
 
296 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  45.85 
 
 
309 aa  289  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  47.64 
 
 
296 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.86 
 
 
326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  46.98 
 
 
305 aa  288  8e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  48.23 
 
 
319 aa  288  8e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  50.65 
 
 
352 aa  288  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.15 
 
 
318 aa  287  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  47.19 
 
 
316 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.46 
 
 
383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  50.66 
 
 
332 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.81 
 
 
319 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  51.47 
 
 
353 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.34 
 
 
340 aa  285  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  52.79 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.41 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>