46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0518 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  386  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  64.86 
 
 
185 aa  263  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  63.78 
 
 
185 aa  260  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  64.32 
 
 
185 aa  258  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  64.32 
 
 
185 aa  258  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  64.32 
 
 
185 aa  258  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  64.32 
 
 
184 aa  256  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  40.78 
 
 
181 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  38.2 
 
 
185 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  36.63 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  36.78 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  35.88 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  33.92 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  32.58 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  29.89 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  37.31 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  33.8 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  28.48 
 
 
358 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  28.92 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  30.88 
 
 
178 aa  61.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  28.17 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  30.57 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  31.11 
 
 
174 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  30.3 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  29.84 
 
 
135 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.84 
 
 
135 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.84 
 
 
135 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  39.44 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  31.16 
 
 
137 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  29.71 
 
 
189 aa  51.2  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  32.84 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  25.17 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  28.12 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  48.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.69 
 
 
133 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  29.19 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  29.05 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  23.94 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  24.39 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  29.5 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  27.14 
 
 
450 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  27.33 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.07 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  29.2 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  39.06 
 
 
144 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>