70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0490 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  70.15 
 
 		 135 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1790  hypothetical protein  49.51 
 
 		 105 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4825  hypothetical protein  41.9 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  36.22 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  36.22 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  36.22 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  34.83 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  35.96 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  34.41 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  46.77 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4234  putative alkylmercury lyase  34.69 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0173287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3236  putative alkylmercury lyase  37.76 
 
 		 108 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  47.46 
 
 		 130 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  42.37 
 
 		 386 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  45.16 
 
 		 91 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2835  putative alkylmercury lyase  42.03 
 
 		 115 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  40.7 
 
 		 133 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  36.25 
 
 		 114 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  41.94 
 
 		 91 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  30.85 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  38.98 
 
 		 111 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  40.68 
 
 		 124 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  40.68 
 
 		 142 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5754  putative alkylmercury lyase  43.08 
 
 		 103 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  34.33 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  38.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  45.9 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  33.78 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  35.94 
 
 		 171 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  28.7 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  38.98 
 
 		 137 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  37.97 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  38.98 
 
 		 130 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1250  putative alkylmercury lyase  29.25 
 
 		 106 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.850349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  37.78 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  52.63 
 
 		 126 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  52.63 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  33.82 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  33.9 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  55.26 
 
 		 126 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  37.04 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  38.33 
 
 		 129 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  40.68 
 
 		 126 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  40.32 
 
 		 103 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  32.04 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  39.53 
 
 		 162 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  37.93 
 
 		 126 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  37.29 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  36.21 
 
 		 97 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  42.86 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  47.37 
 
 		 121 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  44.83 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  34.62 
 
 		 130 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  44.74 
 
 		 128 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  35.59 
 
 		 386 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0334  putative alkylmercury lyase  21.21 
 
 		 104 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>