More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0374 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  65.75 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  60.55 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  57.94 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  51.95 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  47.56 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  46.49 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  52.68 
 
 		 126 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  52.13 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  32.51 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  37.24 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  43.02 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  38.84 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  36.3 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  32.56 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  39.81 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  42.65 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  30.28 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 136 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  53.12 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  35.05 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 128 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  34.91 
 
 		 129 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 141 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 136 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  32.84 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  30.91 
 
 		 132 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 129 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 149 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 149 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  34.91 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 157 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 133 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  41.79 
 
 		 144 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 146 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.17 
 
 		 132 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 146 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 171 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 143 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 279 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 133 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.48 
 
 		 135 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 117 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  39.02 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  52  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  26.16 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  37.76 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>