122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0373 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 		 357 aa  703    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  35.96 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  31.76 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  33.91 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.08 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.11 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.81 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.74 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.1 
 
 		 353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  32.31 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.4 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  40.46 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  41.22 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  35.18 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  32.89 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.4 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  35.98 
 
 		 244 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  36.89 
 
 		 322 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  32.03 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  33.2 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  24.35 
 
 		 795 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.94 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  31.92 
 
 		 282 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.87 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.07 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.53 
 
 		 471 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  34.4 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.17 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  34.78 
 
 		 314 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.77 
 
 		 451 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.82 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  23.7 
 
 		 1002 aa  89.4  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  29.49 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.66 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  29.96 
 
 		 486 aa  87  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.46 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  33.16 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  26.92 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.49 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.13 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.92 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.57 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  23.55 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.02 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  25.16 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.32 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  24.77 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  31.22 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.39 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.07 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  26.53 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.31 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.49 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  31.16 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.33 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  23.4 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  32.79 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  29.29 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  33.65 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.31 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  30 
 
 		 576 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  26.58 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.08 
 
 		 659 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  29.27 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  32.32 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  25.45 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  26.72 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.27 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  31.15 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  25.17 
 
 		 268 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  24.87 
 
 		 461 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.96 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  24.66 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  31.07 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  30.08 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  29.63 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  34.74 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  32.69 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  24.62 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  26.71 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  30.25 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  24.85 
 
 		 215 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  24.44 
 
 		 214 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  25.22 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  31.68 
 
 		 432 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  26.23 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  25.69 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.95 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  27.93 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  30.91 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  23.89 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25.32 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  29.51 
 
 		 529 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  22.71 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  29.17 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  26.23 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>