More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0337 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  74.9 
 
 		 877 aa  1129    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 871 aa  1763    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  47.72 
 
 		 819 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  47.73 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.71 
 
 		 747 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  42.05 
 
 		 773 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  39.43 
 
 		 801 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  38.51 
 
 		 789 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  39.86 
 
 		 744 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  40.17 
 
 		 892 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  40.8 
 
 		 739 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 		 807 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 		 820 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.65 
 
 		 737 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.26 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  41.35 
 
 		 1057 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  36.86 
 
 		 740 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 758 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  40.99 
 
 		 758 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.51 
 
 		 759 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  37.55 
 
 		 821 aa  386  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 		 766 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.26 
 
 		 821 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  38.13 
 
 		 721 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 		 695 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  38.19 
 
 		 726 aa  356  8.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  34.37 
 
 		 801 aa  356  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  36.48 
 
 		 830 aa  352  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  34.36 
 
 		 833 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  35.2 
 
 		 771 aa  348  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 		 808 aa  347  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.05 
 
 		 763 aa  344  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  34.84 
 
 		 784 aa  343  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  35.92 
 
 		 814 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  40 
 
 		 680 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 840 aa  338  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 		 705 aa  334  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.78 
 
 		 720 aa  331  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 		 700 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 710 aa  328  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  39.72 
 
 		 703 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 710 aa  323  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  34.83 
 
 		 765 aa  319  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  34.05 
 
 		 807 aa  317  8e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.21 
 
 		 816 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 816 aa  314  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 		 816 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 		 816 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 		 828 aa  312  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 818 aa  312  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  32.83 
 
 		 727 aa  310  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 		 817 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  34.34 
 
 		 838 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 723 aa  305  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 766 aa  304  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.69 
 
 		 817 aa  301  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.2 
 
 		 761 aa  300  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 830 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  35.24 
 
 		 693 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 831 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 831 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 695 aa  293  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  34.44 
 
 		 722 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  32.94 
 
 		 810 aa  290  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.04 
 
 		 772 aa  288  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 824 aa  286  8e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  31.57 
 
 		 773 aa  278  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 		 643 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 		 643 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.76 
 
 		 727 aa  277  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  32.85 
 
 		 836 aa  276  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 		 643 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 761 aa  274  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  35.38 
 
 		 761 aa  273  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.16 
 
 		 723 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  32.37 
 
 		 817 aa  266  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  35.6 
 
 		 764 aa  264  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  30.96 
 
 		 768 aa  263  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.61 
 
 		 750 aa  262  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.51 
 
 		 710 aa  261  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.96 
 
 		 905 aa  261  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 1245 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.66 
 
 		 640 aa  259  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.38 
 
 		 712 aa  258  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.88 
 
 		 618 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  29.89 
 
 		 727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.31 
 
 		 776 aa  254  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.82 
 
 		 890 aa  253  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.17 
 
 		 648 aa  251  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 714 aa  250  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 768 aa  250  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.69 
 
 		 704 aa  249  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 		 710 aa  249  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 661 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  30.57 
 
 		 759 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.81 
 
 		 806 aa  243  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  32.11 
 
 		 658 aa  243  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.64 
 
 		 714 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.15 
 
 		 765 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>