More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0299 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
608 aa  1162    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  70.62 
 
 
595 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.77 
 
 
358 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.6 
 
 
325 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 
189 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  73.99 
 
 
184 aa  256  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  53.74 
 
 
337 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.54 
 
 
182 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  73.96 
 
 
179 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.29 
 
 
334 aa  252  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  67.05 
 
 
180 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  52.65 
 
 
324 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  69.94 
 
 
183 aa  246  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  69.14 
 
 
190 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68 
 
 
183 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  69.36 
 
 
184 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
184 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.74 
 
 
179 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0203  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
184 aa  242  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.727257  normal  0.158525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  72.16 
 
 
195 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  67.25 
 
 
183 aa  239  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
183 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 
676 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.36 
 
 
183 aa  231  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.53 
 
 
184 aa  230  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 
190 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.32 
 
 
179 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.85 
 
 
190 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.6 
 
 
321 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.49 
 
 
344 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 
222 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.71 
 
 
183 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.43 
 
 
339 aa  213  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
181 aa  212  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5377  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
194 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.23 
 
 
183 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1412  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.83 
 
 
191 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.82 
 
 
176 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.66 
 
 
180 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35700  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68 
 
 
184 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.175987  normal  0.670419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
179 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0556  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.1 
 
 
188 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0834  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.95 
 
 
195 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.1 
 
 
182 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4775  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.53 
 
 
211 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.53 
 
 
211 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196918  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5161  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.53 
 
 
211 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.94 
 
 
398 aa  203  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.36 
 
 
181 aa  203  8e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
178 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.86 
 
 
224 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 
190 aa  200  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
174 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
189 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
183 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.58 
 
 
344 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
186 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
180 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 
181 aa  196  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.06 
 
 
335 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
180 aa  193  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.12 
 
 
216 aa  193  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0149578  hitchhiker  0.000159475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.05 
 
 
333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.43 
 
 
333 aa  191  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.08 
 
 
386 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.32 
 
 
175 aa  190  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
181 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
181 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.21 
 
 
376 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
179 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 
182 aa  187  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
180 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.42 
 
 
341 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
180 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
180 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
180 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
188 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.35 
 
 
199 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
180 aa  182  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
174 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
186 aa  180  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.25 
 
 
324 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 
682 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.07 
 
 
181 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1847  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
187 aa  177  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.17 
 
 
351 aa  177  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.58 
 
 
388 aa  176  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
178 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
178 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
176 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
177 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>