60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0264 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  100 
 
 		 880 aa  1757    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  53.91 
 
 		 545 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  82.14 
 
 		 725 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  42.92 
 
 		 525 aa  314  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  42.24 
 
 		 427 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  44.29 
 
 		 377 aa  270  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  36.35 
 
 		 650 aa  237  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  33.84 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  37.44 
 
 		 535 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  34.58 
 
 		 685 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  33.67 
 
 		 636 aa  204  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  34.15 
 
 		 521 aa  203  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  28.78 
 
 		 739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 576 aa  193  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  29.64 
 
 		 866 aa  193  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  29.38 
 
 		 572 aa  188  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  34.35 
 
 		 399 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  35.48 
 
 		 643 aa  180  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  27.73 
 
 		 746 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  40.6 
 
 		 867 aa  161  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  39.16 
 
 		 815 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  33.83 
 
 		 868 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  33.83 
 
 		 868 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  33.83 
 
 		 868 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  43.09 
 
 		 590 aa  125  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  39.91 
 
 		 718 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1776 aa  110  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  34.53 
 
 		 732 aa  95.5  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  35.09 
 
 		 278 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  32.71 
 
 		 738 aa  94  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  29.54 
 
 		 317 aa  92.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  39.78 
 
 		 437 aa  92.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  29.69 
 
 		 701 aa  88.2  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  29.18 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  31.46 
 
 		 756 aa  76.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1027 aa  68.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  31.46 
 
 		 895 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.34 
 
 		 731 aa  62.4  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  29.5 
 
 		 798 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  34.18 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  34.42 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  34.42 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  29.73 
 
 		 741 aa  57.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  34.42 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  46.38 
 
 		 141 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  30.65 
 
 		 716 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  32.54 
 
 		 760 aa  52.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  31.65 
 
 		 712 aa  52.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  25.59 
 
 		 631 aa  52  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  53.19 
 
 		 127 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  48.94 
 
 		 136 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  47.83 
 
 		 147 aa  51.6  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  31.94 
 
 		 755 aa  51.6  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  32.85 
 
 		 682 aa  49.7  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4918  putative ATP-binding protein  37.37 
 
 		 160 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  41.67 
 
 		 293 aa  48.5  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  35.29 
 
 		 930 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  29.57 
 
 		 759 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  32.6 
 
 		 765 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  34.45 
 
 		 759 aa  45.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>