More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0256 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  100 
 
 		 373 aa  733    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  79.53 
 
 		 368 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  70 
 
 		 317 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  67.54 
 
 		 306 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  63.96 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  65.92 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  64.26 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  65.79 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  65.79 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  65.79 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  63.93 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  60.39 
 
 		 312 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  62.58 
 
 		 301 aa  358  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  61.18 
 
 		 335 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  58.25 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  55.52 
 
 		 348 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  58.88 
 
 		 320 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 301 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.03 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  59.03 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  59.93 
 
 		 306 aa  339  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  54.94 
 
 		 324 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  58.55 
 
 		 314 aa  335  9e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  57.93 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  54.57 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  59.93 
 
 		 305 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  57.19 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  56.63 
 
 		 314 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.44 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  57.24 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  57.7 
 
 		 306 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  56.04 
 
 		 318 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  56.03 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  53.95 
 
 		 313 aa  318  7e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  56.11 
 
 		 313 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  52.55 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  57.14 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  54.72 
 
 		 313 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  51.23 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  52.09 
 
 		 309 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.92 
 
 		 302 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.59 
 
 		 310 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  53.75 
 
 		 318 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  52.96 
 
 		 303 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.4 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  54.46 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  55.41 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.44 
 
 		 305 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  50 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  53.77 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  49.7 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.56 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  59.39 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  52.56 
 
 		 311 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  55.34 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  50 
 
 		 298 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  49.67 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  47.32 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.64 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.61 
 
 		 252 aa  256  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.76 
 
 		 368 aa  255  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.81 
 
 		 319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.76 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  57.48 
 
 		 241 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 244 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.32 
 
 		 300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.65 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  55.87 
 
 		 234 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.44 
 
 		 350 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  47 
 
 		 298 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  46.64 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  54.84 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  58.82 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  47.1 
 
 		 302 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  43.52 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.88 
 
 		 238 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  51.32 
 
 		 245 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 297 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48.67 
 
 		 299 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.54 
 
 		 247 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  48.33 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 242 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  45.48 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  43.45 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 237 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  44.7 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  52.53 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  51.15 
 
 		 232 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  43.35 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.13 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  41.61 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.07 
 
 		 300 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>