83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0160 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  73.02 
 
 		 381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  55.41 
 
 		 316 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  49.35 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  48.23 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  40.96 
 
 		 348 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  27.32 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  31.23 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  28.18 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  31.21 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  27.88 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.95 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  31.1 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  30.12 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  30.58 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  28.09 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  28.09 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  30.27 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  29.39 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  27.69 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  29.97 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  32.31 
 
 		 843 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  49.06 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  43.28 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  41.18 
 
 		 451 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  28.66 
 
 		 523 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  34.62 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  33.91 
 
 		 463 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  37.31 
 
 		 421 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  24.73 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  34.48 
 
 		 447 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  38.37 
 
 		 482 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  48.84 
 
 		 647 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  38.24 
 
 		 448 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  39.39 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  39.71 
 
 		 469 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  37.31 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  31.2 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30.54 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  39.13 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  29.67 
 
 		 479 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  46.15 
 
 		 647 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  46.15 
 
 		 647 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  20.41 
 
 		 413 aa  43.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  41.18 
 
 		 425 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  38.33 
 
 		 426 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  34.21 
 
 		 495 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  37.1 
 
 		 455 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  27.63 
 
 		 423 aa  42.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  34.78 
 
 		 456 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  43.14 
 
 		 484 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>