More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0149 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  69.57 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  50.91 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  48.67 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  49.56 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  47.83 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  47.41 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  43.97 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  44.14 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  43.52 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  43.52 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  43.52 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  48.21 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  47.22 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  46.3 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  45.54 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40.19 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  46.36 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  40.95 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  46.24 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.95 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.95 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42.45 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  39.39 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 		 220 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.27 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  37.37 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.16 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  46.05 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  49.46 
 
 		 356 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  49.46 
 
 		 356 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 108 aa  76.6  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  49.46 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  48.39 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  35.35 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  36.46 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  40.82 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  48.39 
 
 		 356 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  47.31 
 
 		 356 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.63 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  44.74 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  50.62 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  49.37 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  39.82 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.86 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 461 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.62 
 
 		 395 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.89 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  43.53 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  43.06 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  42.53 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.38 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  37.8 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.45 
 
 		 472 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.19 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  36.19 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.38 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>