More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0138 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
467 aa  922  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  72.08 
 
 
469 aa  552  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.23 
 
 
482 aa  339  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  47.4 
 
 
441 aa  327  2e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  46.68 
 
 
478 aa  328  2e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  60.64 
 
 
472 aa  310  3e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  44.06 
 
 
514 aa  307  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  46.19 
 
 
474 aa  305  9e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  44.47 
 
 
426 aa  303  4e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  49.86 
 
 
505 aa  303  6e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  50.79 
 
 
477 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  43.72 
 
 
421 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  50.27 
 
 
478 aa  290  5e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  41.85 
 
 
519 aa  290  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  61.92 
 
 
540 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  44.31 
 
 
463 aa  287  3e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  46.87 
 
 
449 aa  283  4e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  45.97 
 
 
491 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.97 
 
 
491 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.97 
 
 
491 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  60.73 
 
 
474 aa  272  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.45 
 
 
517 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  58.39 
 
 
516 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  37.88 
 
 
500 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  42.86 
 
 
479 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  41.73 
 
 
466 aa  254  2e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  55 
 
 
265 aa  253  5e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  55.56 
 
 
463 aa  252  8e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  41.92 
 
 
462 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  37.88 
 
 
507 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.27 
 
 
438 aa  243  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  55.56 
 
 
253 aa  234  2e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  56.1 
 
 
255 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  54.2 
 
 
247 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.03 
 
 
564 aa  226  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  54.13 
 
 
259 aa  223  5e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  33.55 
 
 
554 aa  223  6e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  53.07 
 
 
364 aa  222  1e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.79 
 
 
241 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  48.55 
 
 
241 aa  214  2e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  37.01 
 
 
519 aa  209  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  57.29 
 
 
687 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  51.69 
 
 
239 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.48 
 
 
239 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
567 aa  201  2e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  44.98 
 
 
571 aa  198  2e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  52.32 
 
 
239 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  41.16 
 
 
558 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  51.07 
 
 
511 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  47.41 
 
 
395 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  47.28 
 
 
425 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  45.23 
 
 
394 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  48.32 
 
 
369 aa  180  6e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  46.78 
 
 
404 aa  173  7e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  48.32 
 
 
355 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  45.45 
 
 
452 aa  167  3e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  45.08 
 
 
361 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  41.78 
 
 
267 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.24 
 
 
247 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  41.7 
 
 
256 aa  157  5e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.98 
 
 
237 aa  156  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  40.51 
 
 
262 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  39.41 
 
 
236 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  40.25 
 
 
238 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  44.3 
 
 
416 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  40.69 
 
 
239 aa  154  3e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 
249 aa  153  6e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  40.77 
 
 
256 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  40.55 
 
 
386 aa  152  9e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  40.39 
 
 
597 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.26 
 
 
422 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.77 
 
 
238 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  38.89 
 
 
276 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.91 
 
 
243 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  2.19679e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  37.89 
 
 
415 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  39.18 
 
 
258 aa  147  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.69 
 
 
611 aa  147  4e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  34.6 
 
 
245 aa  147  4e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  37.85 
 
 
323 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.24067e-08 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  39.51 
 
 
256 aa  146  7e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  48.66 
 
 
267 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 
241 aa  146  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  41.38 
 
 
293 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  45.22 
 
 
236 aa  146  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 
254 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  39.74 
 
 
239 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  36.07 
 
 
325 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  39.67 
 
 
320 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.11 
 
 
252 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  42.34 
 
 
305 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  36.97 
 
 
247 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  36.97 
 
 
247 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  34.38 
 
 
257 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  40.44 
 
 
276 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.13 
 
 
239 aa  143  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  41.91 
 
 
236 aa  143  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  40.23 
 
 
280 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  39.3 
 
 
239 aa  142  1e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  38.4 
 
 
245 aa  142  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.79403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
319 aa  142  1e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>