More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0136 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 482 aa  978    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  78.29 
 
 		 480 aa  746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  56.64 
 
 		 485 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  51.23 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  51.23 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  51.23 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  53.58 
 
 		 489 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.59 
 
 		 483 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.8 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  50 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.83 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.07 
 
 		 485 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.04 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  48.68 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  47.76 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.45 
 
 		 489 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.09 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.04 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  45.74 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.55 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  48.26 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.83 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.6 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.36 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  44.08 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  44.24 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.92 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  42.8 
 
 		 482 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  44.29 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  44.92 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  43.82 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  43.06 
 
 		 488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.98 
 
 		 486 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.8 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  43.7 
 
 		 481 aa  322  7e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  40.6 
 
 		 492 aa  322  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  39.55 
 
 		 488 aa  322  9.000000000000001e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.16 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  40.49 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  38.43 
 
 		 489 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.45 
 
 		 478 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  34.23 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 		 924 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.97 
 
 		 493 aa  251  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  36.93 
 
 		 933 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  33.41 
 
 		 972 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.8 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  35.8 
 
 		 921 aa  237  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 487 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 487 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 577 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 		 547 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 		 570 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  34.89 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 578 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 		 503 aa  206  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 954 aa  201  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  35.65 
 
 		 615 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.78 
 
 		 640 aa  180  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 		 586 aa  179  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 		 631 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 631 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  33.84 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 		 646 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.91 
 
 		 646 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  36.29 
 
 		 629 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  31.95 
 
 		 708 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 		 643 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.15 
 
 		 646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  35.49 
 
 		 631 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  33.87 
 
 		 645 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.75 
 
 		 609 aa  173  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 		 610 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 630 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 		 629 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 765 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 		 723 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  31.1 
 
 		 596 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  30.67 
 
 		 647 aa  170  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 634 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 632 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 709 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 		 634 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.66 
 
 		 695 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.42 
 
 		 641 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 		 640 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 		 551 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 535 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 		 611 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  27.73 
 
 		 599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>