More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0124 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
175 aa  357  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  86.86 
 
 
175 aa  323  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  66.67 
 
 
176 aa  233  9e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  61.99 
 
 
174 aa  226  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  63.64 
 
 
178 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  64.2 
 
 
176 aa  223  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  65.29 
 
 
173 aa  220  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  66.67 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  62.65 
 
 
174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  63.31 
 
 
176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  63.95 
 
 
181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  62.79 
 
 
181 aa  214  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  66.08 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  59.78 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  65.71 
 
 
176 aa  209  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  63.39 
 
 
193 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  63.79 
 
 
176 aa  205  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  63.16 
 
 
182 aa  204  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  56.98 
 
 
179 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  63.01 
 
 
176 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.74 
 
 
182 aa  200  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  59.88 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  59.88 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  56.36 
 
 
172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  59.52 
 
 
206 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  54.76 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  61.68 
 
 
180 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  69.59 
 
 
168 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  63.22 
 
 
177 aa  191  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  61.45 
 
 
179 aa  191  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  68.92 
 
 
168 aa  190  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  68.92 
 
 
168 aa  190  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  66.23 
 
 
168 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  59.22 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  54.12 
 
 
266 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.71 
 
 
201 aa  184  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  62.05 
 
 
173 aa  184  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  61.31 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
175 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
175 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  59.88 
 
 
182 aa  182  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
175 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  60.59 
 
 
178 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  54.22 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  54.82 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  60.82 
 
 
170 aa  179  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  52.98 
 
 
241 aa  178  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  52.35 
 
 
287 aa  177  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  54.91 
 
 
178 aa  173  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  56 
 
 
310 aa  171  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.43 
 
 
310 aa  171  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  58.58 
 
 
177 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  51.79 
 
 
657 aa  166  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  52.75 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.24 
 
 
376 aa  164  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.41 
 
 
378 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  51.79 
 
 
665 aa  159  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46 
 
 
218 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.88 
 
 
372 aa  158  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  57.4 
 
 
172 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  49.09 
 
 
629 aa  156  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.34 
 
 
189 aa  155  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  52 
 
 
310 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  47.62 
 
 
571 aa  152  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  52.1 
 
 
629 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
179 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.42 
 
 
357 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  54.17 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  47.65 
 
 
174 aa  145  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  42.42 
 
 
197 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  56.16 
 
 
197 aa  140  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  51.39 
 
 
376 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52 
 
 
164 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.64 
 
 
322 aa  138  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  43.22 
 
 
223 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  51.88 
 
 
372 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  51.63 
 
 
172 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
167 aa  136  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.94 
 
 
230 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  53.74 
 
 
164 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.2 
 
 
230 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  47.77 
 
 
254 aa  134  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  53.06 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  53.15 
 
 
254 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.86 
 
 
195 aa  134  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  46.07 
 
 
181 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  45.96 
 
 
366 aa  131  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.65 
 
 
202 aa  131  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01290  cyclophilin A, putative  49.68 
 
 
196 aa  130  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.402029  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  45.56 
 
 
178 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  51.72 
 
 
163 aa  130  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  47.3 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18458  predicted protein  49.04 
 
 
194 aa  129  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.97 
 
 
195 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7102  predicted protein  49.68 
 
 
164 aa  129  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0596707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  44.12 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  39 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01230  cyclophilin A, putative  46.79 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  45.93 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23164  predicted protein  45.56 
 
 
489 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.137553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>