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for query gene Franean1_0122 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0122  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00259509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.91 
 
 		 508 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 490 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 483 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 530 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 481 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 		 763 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  33.91 
 
 		 470 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.17 
 
 		 519 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 491 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 501 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 519 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.8 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  35.5 
 
 		 505 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 500 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 509 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 553 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.02 
 
 		 788 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 		 487 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 498 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 505 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 482 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 490 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 486 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 501 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.62 
 
 		 504 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.93 
 
 		 493 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 514 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 496 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.85 
 
 		 489 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 469 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 		 487 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 		 479 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.91 
 
 		 463 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 487 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 488 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.62 
 
 		 499 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 479 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  39.01 
 
 		 492 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.79 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 503 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.29 
 
 		 479 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.61 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  30.8 
 
 		 492 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.58 
 
 		 506 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.83 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.25 
 
 		 527 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  33.58 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.87 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.78 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  31.54 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 		 543 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.85 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 		 520 aa  75.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 480 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 487 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  32.37 
 
 		 480 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  32.37 
 
 		 480 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.42 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  38.85 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4511  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0561268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  41.79 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1035  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.69 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.61 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 510 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 		 542 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
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NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 486 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27 
 
 		 522 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  38.97 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 		 510 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 		 472 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
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NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
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NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 733 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  32.85 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 543 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
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