More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0112 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 478 aa  987    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.58 
 
 		 490 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.44 
 
 		 486 aa  694    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.08 
 
 		 485 aa  771    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  70.36 
 
 		 498 aa  714    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.02 
 
 		 473 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.63 
 
 		 493 aa  726    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.22 
 
 		 478 aa  840    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.58 
 
 		 491 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  77.78 
 
 		 483 aa  785    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  71.97 
 
 		 488 aa  707    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.55 
 
 		 472 aa  641    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.68 
 
 		 512 aa  701    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.6 
 
 		 519 aa  706    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.73 
 
 		 473 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.88 
 
 		 471 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  77.26 
 
 		 485 aa  784    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.59 
 
 		 491 aa  700    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.31 
 
 		 478 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  74.27 
 
 		 495 aa  728    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.99 
 
 		 492 aa  715    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.8 
 
 		 491 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 		 498 aa  733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  74.37 
 
 		 484 aa  735    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  77.62 
 
 		 478 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.5 
 
 		 495 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.15 
 
 		 485 aa  768    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.55 
 
 		 472 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.8 
 
 		 491 aa  703    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.85 
 
 		 489 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.06 
 
 		 489 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.11 
 
 		 496 aa  794    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  65.64 
 
 		 512 aa  635    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  72.75 
 
 		 489 aa  721    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.52 
 
 		 487 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.39 
 
 		 492 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  69.43 
 
 		 506 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.26 
 
 		 496 aa  791    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.94 
 
 		 476 aa  780    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  84.45 
 
 		 475 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.26 
 
 		 476 aa  761    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.27 
 
 		 464 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.85 
 
 		 489 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.06 
 
 		 485 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  85.29 
 
 		 476 aa  864    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.78 
 
 		 486 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  82.35 
 
 		 475 aa  823    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.01 
 
 		 494 aa  688    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.18 
 
 		 479 aa  631  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.4 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.4 
 
 		 471 aa  631  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.7 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 		 480 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.02 
 
 		 480 aa  631  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.54 
 
 		 479 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.42 
 
 		 473 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.11 
 
 		 496 aa  624  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.42 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.26 
 
 		 481 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.05 
 
 		 476 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.69 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.54 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.92 
 
 		 471 aa  621  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.26 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.88 
 
 		 480 aa  622  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.36 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.35 
 
 		 474 aa  617  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.97 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.13 
 
 		 465 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.19 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 		 479 aa  614  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.84 
 
 		 472 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.52 
 
 		 474 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.76 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.99 
 
 		 472 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  62.78 
 
 		 481 aa  613  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.99 
 
 		 470 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.94 
 
 		 474 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.35 
 
 		 476 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.21 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.63 
 
 		 466 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.92 
 
 		 474 aa  609  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34856  predicted protein  65.49 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0352845  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 		 476 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.5 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.48 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.42 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.52 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.42 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.58 
 
 		 472 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.29 
 
 		 473 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.21 
 
 		 473 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.52 
 
 		 472 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.71 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.13 
 
 		 468 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>