84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0100 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  42.42 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 393 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 394 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 394 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 394 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 497 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  32.91 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 204 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 222 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 206 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 206 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 219 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 206 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 239 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  29.41 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  25.14 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.41 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.41 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>