230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0097 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
340 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  72.78 
 
 
343 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  72.49 
 
 
343 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  72.49 
 
 
350 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  72.49 
 
 
350 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  72.19 
 
 
350 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  37.57 
 
 
350 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
353 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  39.87 
 
 
342 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  37.34 
 
 
349 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  34.19 
 
 
350 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 
354 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 
354 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 
354 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 
350 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.3 
 
 
349 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  34.84 
 
 
339 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
344 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
353 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
338 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
355 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 
315 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  31.95 
 
 
348 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  32.68 
 
 
356 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
341 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 
359 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 
348 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 
354 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.37 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  31.37 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  31.92 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
355 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  30.32 
 
 
354 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  30.12 
 
 
429 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 
358 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
346 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  32.87 
 
 
353 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
355 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  30.85 
 
 
355 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  30.98 
 
 
357 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  31.41 
 
 
346 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  32.7 
 
 
353 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  31.51 
 
 
344 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 
350 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
344 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  31.83 
 
 
354 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
344 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  32.48 
 
 
353 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 
355 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
356 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  31.06 
 
 
358 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
358 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
354 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 
363 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
358 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 
368 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
362 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  30.09 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  31.8 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 
364 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  30.39 
 
 
352 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  30.99 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  30.12 
 
 
368 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  30.12 
 
 
368 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  30.12 
 
 
368 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  30.12 
 
 
368 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  27.65 
 
 
403 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  29.97 
 
 
379 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  30.58 
 
 
339 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  30.12 
 
 
368 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  30.12 
 
 
368 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  30.12 
 
 
368 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30.09 
 
 
343 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
358 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 
339 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  30.33 
 
 
368 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  30.74 
 
 
356 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  29.82 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  30.21 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 
361 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 
361 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>