59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0093 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
303 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  30.36 
 
 
295 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0327  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
279 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0162  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  26.53 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
252 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  32.07 
 
 
263 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  47.73 
 
 
267 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
278 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  42.16 
 
 
267 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  42.72 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0964  putative esterase/hydrolase  29.7 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  31.44 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.3 
 
 
434 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  30.2 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  24.39 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5930  hypothetical protein  29.18 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.615231  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  27.93 
 
 
272 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  39.42 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.65 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  27.12 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.52 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 
265 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3507  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
282 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.973845  normal  0.812562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
291 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  39.56 
 
 
251 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0145  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
437 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.12 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.67 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.57 
 
 
425 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2752  hydrolase, alpha/beta fold family  21.35 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120661  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  26.32 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  35.45 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
317 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 
360 aa  42.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>