More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0092 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  49.03 
 
 		 315 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  48.51 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  39.91 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  37.55 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 255 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 		 248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  36.13 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 252 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 272 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 249 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 241 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 253 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 268 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 223 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.2 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.39 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  42.48 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  32.99 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  35.35 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.08 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6620  tetracycline repressor domain-containing protein  33.11 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.91 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  30.67 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  27.23 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>