More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0088 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  100 
 
 
491 aa  996    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  77.16 
 
 
325 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  57.84 
 
 
449 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  66.26 
 
 
328 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  66.56 
 
 
335 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  68.2 
 
 
329 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  65 
 
 
328 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  67.88 
 
 
317 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  65.23 
 
 
328 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  67.77 
 
 
329 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  64.46 
 
 
324 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  66.36 
 
 
328 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  64.55 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  65.62 
 
 
328 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  67.08 
 
 
327 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  64.15 
 
 
328 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  64.03 
 
 
330 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  63.04 
 
 
330 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  64.56 
 
 
334 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  62.61 
 
 
330 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  63.16 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  62.26 
 
 
334 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  58.36 
 
 
330 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  62.03 
 
 
324 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.57 
 
 
331 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  59.51 
 
 
331 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  60 
 
 
331 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  61.08 
 
 
331 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  63.25 
 
 
328 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  63.55 
 
 
332 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  62.34 
 
 
309 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  61.08 
 
 
340 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  60.76 
 
 
326 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  64.35 
 
 
324 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  59.5 
 
 
331 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  57.98 
 
 
331 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  64.31 
 
 
329 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  64.65 
 
 
329 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  62.23 
 
 
330 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  59.81 
 
 
330 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  61.99 
 
 
328 aa  369  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  59.32 
 
 
330 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  57.94 
 
 
326 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  53.92 
 
 
326 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  56.97 
 
 
328 aa  356  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  57.05 
 
 
331 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
331 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  60.33 
 
 
330 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  55.52 
 
 
331 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  59.14 
 
 
332 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
330 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  59.75 
 
 
338 aa  345  8e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  55.91 
 
 
338 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  55.14 
 
 
333 aa  344  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  54.17 
 
 
327 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
320 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
360 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  54.74 
 
 
328 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  53.56 
 
 
328 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  55.77 
 
 
325 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  52.83 
 
 
331 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  55.59 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  56.7 
 
 
320 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  54.04 
 
 
335 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  56.04 
 
 
328 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  55.91 
 
 
326 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  54.35 
 
 
334 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  52.85 
 
 
329 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  54.37 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  52.22 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  53.87 
 
 
327 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
327 aa  326  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.9 
 
 
329 aa  325  9e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  51.9 
 
 
329 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.9 
 
 
329 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  51.09 
 
 
334 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  52.05 
 
 
327 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
336 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  52.22 
 
 
329 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  51.42 
 
 
331 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
328 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  51.57 
 
 
331 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  52.37 
 
 
335 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  52.17 
 
 
334 aa  323  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  51.58 
 
 
329 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
339 aa  322  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.11 
 
 
329 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  53.68 
 
 
331 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  50.63 
 
 
327 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  51.68 
 
 
327 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
327 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  50.62 
 
 
328 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  53.11 
 
 
331 aa  317  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  52.85 
 
 
344 aa  317  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  52.48 
 
 
331 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  52.48 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  52.62 
 
 
328 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
329 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>