38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0087 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  43.43 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  44.33 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  43.43 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  42.27 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  42.27 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  44.68 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  42.27 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  42.55 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  41.9 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  36.08 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  36.56 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  39.33 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  41.03 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  45.21 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  43.24 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  41.77 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  44.87 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  41.77 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  44.59 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  37.76 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  42.31 
 
 		 93 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0101  hypothetical protein  72.41 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.242091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  41.25 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  35.06 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  36 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  33.68 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  34.52 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  34.67 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  39.36 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  29.07 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>