More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0086 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  850    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0308  ABC transporter related protein  63.2 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  59.06 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  61.01 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  57.04 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  56.74 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  55.06 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  51.03 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  50.13 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  43.08 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.04 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.15 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.95 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.6 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  34.39 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.54 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.1 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.47 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.03 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  31.15 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.68 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.12 
 
 		 658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.83 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  29.2 
 
 		 644 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  26.52 
 
 		 641 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.51 
 
 		 400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.97 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  29.33 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.44 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  30.36 
 
 		 656 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.77 
 
 		 657 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  26.52 
 
 		 641 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  30.2 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.28 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.76 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 409 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  32.04 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27.34 
 
 		 641 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  30.94 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.94 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.21 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  32.02 
 
 		 655 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 		 420 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  29.58 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.53 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  31.06 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  29.5 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.88 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  31.07 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  29.52 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  31.93 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.85 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.23 
 
 		 409 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  32.13 
 
 		 671 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.23 
 
 		 409 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  26.67 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.45 
 
 		 696 aa  123  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  28.11 
 
 		 418 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 402 aa  123  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.53 
 
 		 656 aa  123  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 		 420 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.5 
 
 		 402 aa  123  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.43 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  28.71 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.64 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  32.23 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.18 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.49 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  27.76 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.81 
 
 		 653 aa  121  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  29.46 
 
 		 654 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  29.77 
 
 		 657 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  30.25 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.23 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>