More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0085 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  66.2 
 
 		 276 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  68.35 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  64.06 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  63.84 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  63.35 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  59.81 
 
 		 218 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  65.42 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25290  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  65.28 
 
 		 242 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.17 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.91 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.67 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.47 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  55.81 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.24 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.23 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  49.06 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.78 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.98 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 240 aa  214  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.75 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  53.15 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  50.75 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  53.15 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  53.15 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  55.09 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  48.74 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  51.76 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  50.45 
 
 		 291 aa  211  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  50.91 
 
 		 277 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  51.71 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50.25 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  51.76 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  50.22 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  48.92 
 
 		 663 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.18 
 
 		 649 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.37 
 
 		 246 aa  207  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.25 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.25 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.37 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  48.92 
 
 		 663 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.94 
 
 		 649 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  49.5 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  51.74 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  53.73 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.66 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  43.38 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.76 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  52.26 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  50.23 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.98 
 
 		 242 aa  204  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  48 
 
 		 653 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.4 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.04 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.51 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  47.39 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  49.26 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.31 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  53.27 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  49.27 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  49.77 
 
 		 655 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  45.7 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  47.53 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.04 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.42 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  48.78 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.57 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  46.08 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.04 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.18 
 
 		 241 aa  201  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  51.96 
 
 		 658 aa  201  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  46.57 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>