More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0082 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.6 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.93 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  63.59 
 
 		 217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  61.4 
 
 		 215 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.67 
 
 		 217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.5 
 
 		 214 aa  264  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  63.85 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.29 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  61.47 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.67 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  59.91 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.68 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 		 222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  58.06 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.42 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.68 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  58.72 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.07 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  55.35 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.83 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.34 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.61 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  53.05 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.07 
 
 		 235 aa  204  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  53 
 
 		 227 aa  201  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 		 243 aa  201  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.3 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.23 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.93 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.15 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  44.04 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  43.64 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.07 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.07 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.84 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.07 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.07 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.74 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  41.82 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  40.62 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  39.27 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  40.62 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  40.62 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.37 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  40.64 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  38.91 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  40.37 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.28 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.83 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  42.27 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  39.73 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>