112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0071 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0071  IS630 family transposase  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3007  IS630 family transposase  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3070  IS630 family transposase  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3168  IS630 family transposase  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4438  IS630 family transposase  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6341  IS630 family transposase  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7159  IS630 family transposase  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0620251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  75.28 
 
 
179 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  49.44 
 
 
181 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  50.93 
 
 
173 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  50.93 
 
 
173 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  44.1 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  40.54 
 
 
160 aa  87  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 
336 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 
336 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 
336 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 
336 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 
336 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 
336 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 
336 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  38.89 
 
 
308 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  28.68 
 
 
311 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.01 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  29.3 
 
 
337 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  28.57 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  28.57 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2414  helix-turn-helix Psq domain protein  28.57 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.203324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  28.57 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2562  helix-turn-helix Psq domain protein  28.57 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  29.3 
 
 
337 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2855  helix-turn-helix Psq domain protein  28.57 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00593097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2582  transposase  36.11 
 
 
145 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  28.77 
 
 
324 aa  52  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  29.17 
 
 
322 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  28.77 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  28.77 
 
 
352 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  35.19 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  35.19 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  35.19 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  35.19 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2446  putative transposase  35.19 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  28.77 
 
 
352 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  27.81 
 
 
350 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  27.81 
 
 
350 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  28.08 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  28.77 
 
 
352 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  28.08 
 
 
332 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  28.08 
 
 
351 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  28.08 
 
 
332 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3674  hypothetical protein  28.93 
 
 
134 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  28.77 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  28.08 
 
 
322 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  24.52 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  24.52 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  24.52 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  28.08 
 
 
243 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  30.34 
 
 
350 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  30.41 
 
 
257 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  23.31 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  23.31 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  23.31 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  24.24 
 
 
159 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  23.31 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  26.62 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  23.31 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  27.4 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0726  helix-turn-helix Psq domain protein  27.56 
 
 
137 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  23.87 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  23.87 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  26.71 
 
 
290 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  30.56 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  27.4 
 
 
352 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  37.7 
 
 
314 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  27.4 
 
 
352 aa  44.7  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  31.96 
 
 
345 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  37.7 
 
 
345 aa  44.3  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  37.7 
 
 
345 aa  44.3  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  37.7 
 
 
345 aa  44.3  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  24.26 
 
 
348 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.95 
 
 
338 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  28.07 
 
 
347 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  28.07 
 
 
352 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  28.07 
 
 
352 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  28.07 
 
 
352 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  26.71 
 
 
350 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  29.41 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  29.08 
 
 
356 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  28.07 
 
 
352 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0578  hypothetical protein  30.6 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  30.3 
 
 
356 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  30.3 
 
 
356 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>