145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0064 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  295  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  89.77 
 
 		 387 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  89.77 
 
 		 387 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  89.77 
 
 		 387 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  51.25 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  39.77 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  49.4 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  38.58 
 
 		 370 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  42.17 
 
 		 365 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  44.58 
 
 		 366 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  50.62 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  50.62 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  43.59 
 
 		 370 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  43.59 
 
 		 370 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4224  hypothetical protein  42.39 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  43.59 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  43.59 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4638  hypothetical protein  42.39 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  43.59 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  50.62 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  42.86 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  42.86 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  44.19 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  41.18 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  45.57 
 
 		 366 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  44.19 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  44.19 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  44.19 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  44.19 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  44.19 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  43.59 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  43.59 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  43.59 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  43.59 
 
 		 340 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  43.59 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  45.68 
 
 		 363 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  47.56 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  47.56 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  47.56 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  42.35 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  41.86 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  44.05 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  42.35 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  42.35 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  47.56 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  47.56 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  45.68 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  47.56 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  59.26 
 
 		 754 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  52.83 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  47.06 
 
 		 375 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7411  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  38.82 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  37.5 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  44.44 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  39.29 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  44.44 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  46.99 
 
 		 363 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  46.99 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  43.21 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  43.21 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5511  hypothetical protein  40.91 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.27076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  54.72 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  38.82 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  52.83 
 
 		 361 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  52.83 
 
 		 361 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  38.82 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  41.03 
 
 		 363 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 363 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  37.65 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  43.53 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 423 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  60.78 
 
 		 376 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  60.78 
 
 		 365 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  39.77 
 
 		 357 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  39.77 
 
 		 357 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  39.77 
 
 		 357 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>