More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0042 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0042  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3576  Resolvase domain protein  67.46 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  hitchhiker  0.005664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4727  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  55.26 
 
 		 337 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  38.99 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  37.85 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.14 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35 
 
 		 182 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  32.58 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.85 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  32.58 
 
 		 181 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 183 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.89 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36 
 
 		 186 aa  88.6  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  31.72 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  33.94 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30 
 
 		 193 aa  85.1  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  33.7 
 
 		 205 aa  85.1  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  35.2 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.12 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.44 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  32.58 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  32.58 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  34.07 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  35.52 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  31 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  36.87 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  32.58 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  34.55 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  34.27 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  32.78 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  32.18 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  34.86 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  33.99 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  35.03 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.99 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  31.82 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.15 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  32.02 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  34.27 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  34.01 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  34.01 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.27 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  37.22 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  31.63 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  32.2 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  31.52 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  28.9 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.33 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  32.58 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  32.58 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  28.9 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.82 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  35.2 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.55 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  36.18 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.68 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  34.23 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  37.5 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  37.25 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  37.25 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  31.67 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  37.59 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  32.22 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  32.56 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  35.06 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  32.58 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  32.58 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  33.89 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  36 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  33.7 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  36 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  36 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  36 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  32.22 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  35.22 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  37.88 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  30.11 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  32.97 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.4 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  31.01 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  33.55 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 		 310 aa  72  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>