73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0041 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
299 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  75.5 
 
 
300 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  74.58 
 
 
301 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  73.31 
 
 
305 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  53.18 
 
 
303 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  50.33 
 
 
301 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  52.15 
 
 
305 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  41.67 
 
 
293 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  39.08 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  39.84 
 
 
287 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  36.24 
 
 
303 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  35.87 
 
 
293 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 
291 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 
310 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  40.15 
 
 
298 aa  148  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
303 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  35.04 
 
 
300 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  36.36 
 
 
474 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.33 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.33 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  32.96 
 
 
292 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.08 
 
 
293 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
292 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
305 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  33.33 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  32.03 
 
 
302 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 
303 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  32.7 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 
323 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  32.97 
 
 
534 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.52 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
299 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  30.66 
 
 
293 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  28.9 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  29.84 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  57.63 
 
 
838 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  24.52 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  38.64 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  23.55 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  26.07 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.93 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  21.84 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  26.09 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  21.52 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  21.52 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1496  aminoglycoside phophotransferase family protein  20.85 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1292  aminoglycoside phophotransferase family protein  21.1 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1264  aminoglycoside phophotransferase  21.1 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.332261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1468  aminoglycoside phophotransferase family protein  21.1 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  21.8 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1397  aminoglycoside phophotransferase family protein  21.1 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  32.74 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  31.98 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  28.47 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19180  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.88 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209047  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0130  aminoglycoside phosphotransferase  37.84 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.670297  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2805  aminoglycoside phosphotransferase  29.21 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.34105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3722  putative macrolide 2-phosphotransferase  33.33 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.097524  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15080  predicted aminoglycoside phosphotransferase  26.85 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
273 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2472  aminoglycoside phosphotransferase  43.14 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0185974  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1589  macrolide 2-phosphotransferase  31.58 
 
 
298 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.194584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1473  macrolide 2-phosphotransferase  31.58 
 
 
298 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1445  macrolide 2-phosphotransferase  31.58 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1659  putative macrolide 2-phosphotransferase  31.58 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.491646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>