More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0018 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0018  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.825328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0032  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  46.85 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  44.64 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  51.35 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  46.43 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0119  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0889  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2547  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  41.96 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  41.07 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  41.96 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>