More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0012 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  80.33 
 
 		 467 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 458 aa  904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  54.57 
 
 		 440 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  54.55 
 
 		 421 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  52.82 
 
 		 421 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  54.39 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  52.56 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  52.46 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  53.9 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0391  glycosyl transferase group 1  53.21 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  50.58 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  51.17 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  51.17 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  51.17 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  49.88 
 
 		 411 aa  363  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  50.35 
 
 		 411 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  44.68 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  45.06 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  41.88 
 
 		 471 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  44.26 
 
 		 452 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0489  glycosyl transferase group 1  46.95 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2006  glycosyl transferase, group 1  39.1 
 
 		 431 aa  249  7e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 422 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.66 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.68 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 421 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.68 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 		 385 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.6 
 
 		 351 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 371 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 423 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.75 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.33 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.49 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.93 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 397 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 		 380 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  31.4 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  31.45 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.39 
 
 		 364 aa  100  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.16 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 524 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 377 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 365 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.36 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 364 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 408 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.15 
 
 		 336 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 357 aa  96.7  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 410 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 424 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 394 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  38.84 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  36.99 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>