66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4415 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  100 
 
 		 175 aa  356  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0159  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  53.36 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 146 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.06 
 
 		 143 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.709341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  37.1 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  33.57 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  29.6 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  29.6 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  29.6 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  27.87 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  27.05 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  27.87 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  27.87 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  27.05 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  27.87 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  28.57 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  26.23 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2056  anti-sigma regulatory factor  30.87 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.773482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  27.4 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 286 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  24.67 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  33.02 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  24.16 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  33.02 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  24.16 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1997  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 495 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0141  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4818  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 1361 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 		 144 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  29.46 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3799  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000337486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  28.33 
 
 		 310 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 321 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 321 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 		 147 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 148 aa  42  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  28.17 
 
 		 282 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  30.77 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  27.87 
 
 		 250 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  22.66 
 
 		 203 aa  40.8  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1839  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.481374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>